Петербургский писатель скончался накануне в больнице, полгода не дожив до 80-летнего юбилея, к которому, по рассказам друзей, готовилось в печать полное собрание сочинений.

В соавторстве с братом Аркадием, за три десятилетия написано около 30 повестей и романов.

Борис Вишневский, депутат Законодательного Собрания Санкт-Петербурга: «Аркадия Натановича не стало в октябре 1991 года, Борис Натанович его пережил на 21 год. Тогда еще говорил, что невозможно одному пилить двуручной пилой, поэтому он почти не писал с тех пор. В основном занимался тем, что систематизировал огромный архив, участвовал в жюри разных литературных конкурсах в Москве молодых писателей. Это был светлый, сильный, бесстрашный человек».

По книгам братьев Стругацких сняты фильмы «Сталкер», «Чародеи», «Обитаемый остров»,  «Дни затмения». У Бориса Стругацкого были и другие ипостаси — астроном, редактор, наставник молодых фантастов, правозащитник. После смерти брата он издал еще два собственных романа под псевдонимом Витицкий.

Место и дата похорон Бориса Стругацкого пока неизвестны.